許多工程師認為，只要定義了FPGA的功能，工作就算完成了。但實際上將FPGA插入PCB時也會面臨一系列挑戰。
對于許多工程師和項目經理來說，在FPGA中實現功能并實現時序收斂是主要目標，但實際上在印刷電路板上設計FPGA的硬件級工作也會出現很多有趣的挑戰，只有解決了這些挑戰才能實現成功設計。
一切的起點均在于架構。硬件開發第一步就是定義解決方案的架構。架構應該對應于系統要求，并具體明確它們如何在硬件中得到實現。雖然不同系統的架構各有差異，而且每個系統的具體應用也大相徑庭，但很多系統均包含類似的架構模塊。您能夠同時也應該對經常需要的硬件模塊進行重復利用，就好像您重利用常用的HDL模塊一樣。
圖1和圖2分別給出了整體架構和電源架構的實例，而兩側則列出了設計FPGA系統時通常需要考慮的問題。
器件選擇
您一開始面臨最重要的選擇就是在大量可用FPGA中找到最合適的。FPGA器件的選擇涉及許多因素。首要因素就是該FPGA提供什么可用資源，是否足夠用來以所需的工作頻率實現您想要的功能。
根據這些參數，您可以很快將選擇范圍細化到有限數量的器件，這樣您就能再進一步細化選擇標準，找到適當的FPGA。另一個重要因素就是您系統可能需要的其它資源，比方說DSP slice或乘法器、嵌入式處理器或高速串行鏈路等。是否提供這些資源，可以進一步縮小器件選擇的范圍。在許多情況下，根據具體資源需求，您會進一步尋找器件的子系列，比方說如果需要邏輯或高速串行鏈路，則應選擇賽靈思Spartan®-6 LX或Spartan-6 LXT。
器件所需的輸入輸出數量會同時影響到器件選擇和封裝選擇，因為一款器件可能提供幾種不同的封裝選擇，每種選擇還提供不同數量的用戶I/O。這里通常需要注意的是，您應當考慮今后如何升級，而且要考慮所選系列的各種器件是否具有通用的封裝尺寸。
此外，選擇器件時您還應考慮工作環境。舉例來說，是不是商業組件就夠了，是否需要工業、醫療或汽車級的部件？某些情況下您的系統可能需要軍用或航天級的組件。
此外，您還必須要考慮到配置架構問題?；?span lang="EN-US">SRAM的FPGA能否滿足應用需求？或者說賽靈思Spartan-3AN系列這樣的非易失性解決方案是否更好一些？設計的安全性同樣也是一大重要考慮因素。如果應用需要設計安全性，就應考慮避免讀回并對數據流進行加密。
無論應用是進行量產或是作為一次性的定制航天設計，組件成本當然也始終是一個重要因素。您應制定目標成本預算，并努力確保在成本限度內完成任務。
上述許多參數在系統中其它器件的選擇上也很重要。特別重要的一個標準就是選擇的組件要能夠在相同的電壓軌上工作，這樣就能簡化電源架構。
您還應考慮在設計中是否有組件標準降低的問題。所有制造商的組件數據手冊都給出了器件的最大額定值和最大工作電應力。如果我們選用的器件剛好在最大額定值以下的電應力工作，那么設計的可靠性就會大幅下降，因為系統一直是在推薦工作條件以外工作的。根據最終應用的不同，故障可能會導致各種后果，包括導致人員傷亡，破壞工作任務，公司質量聲譽下挫等。為了生產出可靠的設備，您必須在設計中減少電應力。因此在選擇應用器件時，您必須考慮到器件所承受的電應力。
電源架構
器件選擇好之后，下一步影響項目成敗最關鍵的部分就是電源架構了。這個因素往往被忽視?，F代FPGA的核心電壓通常介于0.9V到1.5 V之間。相對于高性能FPGA而言，這種器件需要的靜態電流可能很高，而且器件完成配置并開始計時后的動態電流也很大。
設計中的功耗估算非常重要，需要在項目早期進行，以準確評估電源架構。賽靈思提供功耗估算電子數據表，您可在以下網址下載：http://www.origin.xilinx.com/prod- ucts/design_tools/logic_design/xpe.htm。在電子數據表中，您可根據選定器件的環境參數選擇FPGA資源的時鐘速率和翻轉率。如果您不確定，寧可做出更謹慎的選擇，也就是要對估算做出悲觀考慮而不是過于樂觀。一旦明確了FPGA的電源要求，就能將其整合到系統的整體功耗預算中，并在此基礎上明確電源架構。
有的系統需要較大電流，我們建議采用開關DC/DC轉換器保持整體效率，確保單元散熱設計不是很復雜。如果需要的電流較低，而且系統必須特別注意避免噪聲，也就是說為高速串行鏈路或敏感型ADC、DAC組件提供電源的話，那么您可采用線性穩壓器和額外的濾波機制。在所有情況下，您都應該仔細閱讀具體器件的數據手冊。
一旦完成FPGA設計，您就應該使用賽靈思ISE®設計套件中的XPower Analyzer獲得詳細的功耗估算。這一步驟將幫助您完成電源架構的設計工作。
此外，您還應考慮板上器件的電源去耦問題?，F代器件的開關速度比調節電壓的電源快很多倍。如果不采用去耦電容，這種局面就會導致當穩壓器上升時電源軌下降。理想情況下，應讓去耦電容的值在結合PCB層間電容時的阻抗曲線低于0.1Ω，而且可能的話應在100 kHz到1 GHz之間。要實現這樣的性能，應采用一系列去耦電容值，每個值都有不同的自諧振頻率。這種方法可讓電源抑制比（PSRR）值不佳的器件也能實現最佳性能，而PSRR在某些器件上會隨工作頻率的上升而下降。
最后，要盡可能減少額外電壓軌的數量，這有助于降低解決方案的復雜性。此外，您還應注意到任何電源軌排序或斜坡速率，并確保您的解決方案能夠滿足這些要求。
時鐘和復位樹
您的系統需要至少一個時鐘工作。通常讓邏輯級振蕩器在所需頻率上工作?？紤]振蕩器時，要注意一系列問題。其中振蕩器所需的輸出頻率和穩定性是關鍵參數。振蕩器穩定性單位為PPM（百萬分之一），通常為+/-50 PPM或+/-100 PPM。
驅動高速串行鏈路或為ADC/DAC提供時鐘的振蕩器通常還需要低相位噪聲和低抖動。保持低噪聲和低抖動非常重要，因為低噪聲有助于降低高速鏈路的誤碼率，而高噪聲和高抖動則會增加ADC和DAC上的噪聲水平，從而降低信噪比。
您還應考慮輸出信號標準。LVDS或LVPECL等差分信號的抗噪性比單端LVCMOS或LVTTL輸出要好。此外，差分信號還能減少EMI問題，加速上升和下降時間。不過，差分信號的相位噪聲性能比單端輸出要差。高性能系統將采用正弦波振蕩器作為主時鐘源以減少相位噪聲和抖動的影響，這在ADC和DAC計時情況下尤其如此。
由于FPGA可在內部支持多個時鐘域，因此目前系統通常采用一個以上的時鐘域。如果不能通過DLL、DCM或PLL等內部時鐘資源實現所需的分頻，那么設計人員往往會采用高速時鐘和低速率時鐘相結合。此外，不同的協議或算法也會需要不同的時鐘頻率，從而在設計中創建多個時鐘和時鐘域。圖3給出了典型的時鐘樹。
