一、布線的層面
Protel98、99的PCB編輯器，可以在16個“Signal Layer（信號層面）”上實現布線，每個都可以單獨設置布線屬性。對雙面板的自動布線來說，應該讓系統僅“在Top（頂層）”和“Bot(底層）”兩個層面布線；對單面板則只能在“Bot（底層）”布線。其他的信號層應該處于禁止自動布線狀態，否則系統會自動使用任何可用的信號層。
設定層面的布線屬性，可在“Design Rules”對話框中設定。執行菜單命令“Design/Rules...”，彈出“Design Rules"對話框，單擊“Routing”選項卡，選中“ Rule Classes”列表框中的“Routing Layers”項，這時顯示的對話框。
然后單擊按鈕“Properties...”后，將彈出“Routing Layers Rule”對話框。
對話框中的“Rule Attributes”項，就是雙面板常用的層面布線屬性。其中水平布線T=“Horizontal”,底層設置成垂直布線B=“Vertical”， 14個中間信號層都設置成不使用1-14=“Not Used”。制作單面板時，因為只有底層是實際布線層，所以要把Bottom Layer的布線方向設定為任意，即B=“Any”,其他都設置成不使用，即“Not Used”。
二、布線的區域
自動布線時必須劃定一個區域，讓系統在限定的區域內進行布線操作。如果沒有明確規定布線區域，Protel98、99的PCB編輯器將有可能（根據電路的復雜程度）使用全部圖紙空間來布線，這肯定是不允許的。設定自動布線的區域，需要使用“Keep Out Layer（禁止布線層）”。因為Protel98、99在信號層自動布線的同時，將不停地檢索與布線位置對應的禁止布線層，如果禁止布線層的對應位置為空，表示給位置可以布線，否則表示該位置禁止布線，這時系統將改變布線的方向，向其他方向搜索可布線的位置。根據這個原理，可以任意規定布線的區域。例如：通常把印制電路板邊界的邊框線畫在“Keep Out Layer（禁止布線層）”上，這樣被限定在印制電路板的邊界內。因此，可以把繪制在“Keep Out Layer”上的圖形稱為“電氣邊界”。
三、布線的其他規則
Protel為自動布線規定了很多默認的規則，設計者通常不需要重新設置，但是應該了解這些規則的內容和意義。
1、Clearance Constraint（安全距離）兩個導體之間的最小距離，默認值=10mil。
2、Routing Corners(布線拐角模式）默認值=45度。
3、Routing Priority（布線優先級別）范圍0-100，數值越大，級別越高。自動布線時，級別高的先走線。
4、Routing Topology(自動布線方式）默認值設置為“Shortest（最短布線長度）”。
5、Routing Via Style（過孔類型） 有3個參數：“Style（類型）”默認值為“Through（通孔）”，孔徑默認值為“Hole Size=28mil”,外徑默認值為“Width=50mil”。
6、Width Constraint(布線寬度） 默認值為10mil。
以上這些規則多可在圖1所示的對話框的“Routing”選項卡“Rule Classes”列表框中找到，每項規則多可以有多哥不同對象設置值。例如，布線寬度可以按網絡名分別設置，電源VCC和接地GND的布線寬度可以設定的粗一些，其他走線細一些，等等。用對話框中的“Add...”按鈕，可將多個作用對象的設置值，加到“Scope”列表框中。
由于可以設定的布線規則非常多，而且有些參數之間又互相有牽連，設置不合適的話，很可能適得其反。因此初學者一般使用默認值即可，等對布線規則的理解程度提高后，在進行高標準的規則設置。